Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf6Q9D4J7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf6Q9D4J7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms