Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lonrf3Q9D4H7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms