Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp2bpQ9D4C6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms