Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D454 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D454 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D454 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D454 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D454 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D454 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D454 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D454 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms