Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms