Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D1F3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D1F3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D1F3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1F3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1F3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1F3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1F3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1F3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D1F3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms