Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E3

Lysmd1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd1Q9D0E3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd1Q9D0E3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd1Q9D0E3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd1Q9D0E3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd1Q9D0E3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms