Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2e1Q9D0D5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms