Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms