Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atg12Q9CQY1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms