Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ykt6Q9CQW1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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