Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nudt21Q9CQF3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nudt21Q9CQF3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms