Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rab5aQ9CQD1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms