Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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