Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg3Q9CPX6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms