Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms