Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrbp1Q99PL5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrbp1Q99PL5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms