Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rassf3Q99P51 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms