Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tsnaxip1Q99P25 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms