Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atoh8Q99NA2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atoh8Q99NA2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms