Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brms1Q99N20 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Brms1Q99N20 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms