Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a6cQ99N08 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms