Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms