Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a9Q99MR3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms