Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clp1Q99LI9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms