Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Abcf2Q99LE6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcf2Q99LE6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms