Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gps1Q99LD4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms