Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pagr1aQ99L02 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms