Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms