Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlgn1Q99K10 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms