Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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