Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc30a1Q99J38 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc30a1Q99J38 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc30a1Q99J38 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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