Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ophn1Q99J31 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms