Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clip1Q922J3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clip1Q922J3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms