Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Odf3Q920N1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms