Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klc3Q91W40 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms