Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sh3bgrl3Q91VW3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms