Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cabp4Q8VHC5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms