Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmcd1Q8VEE1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmcd1Q8VEE1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms