Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Uhrf1Q8VDF2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Uhrf1Q8VDF2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1Q8VDF2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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