Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnajc28Q8VCE1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms