Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms