Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms