Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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