Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b4Q8QZY9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms