Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms