Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ssh3Q8K330 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ssh3Q8K330 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ssh3Q8K330 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ssh3Q8K330 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ssh3Q8K330 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssh3Q8K330 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssh3Q8K330 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssh3Q8K330 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssh3Q8K330 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssh3Q8K330 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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