Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Prpf39Q8K2Z2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prpf39Q8K2Z2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prpf39Q8K2Z2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prpf39Q8K2Z2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf39Q8K2Z2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms