Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrrdQ8K2M3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrrdQ8K2M3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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