Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd3Q8K2F0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms